田間生長的中飼苧1號(左)和青葉苧麻。劉頭明供圖
中飼苧1號(左)和青葉苧麻。劉頭明供圖
從一根莖中剝?nèi)〉睦w維,左為中飼苧1號,右為青葉苧麻。劉頭明供圖
?苧麻基因組特征? ? ? ? 劉頭明供圖
近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究所聯(lián)合有關(guān)單位開展野生和栽培苧麻基因組比較及群體進(jìn)化分析,首次系統(tǒng)揭示了苧麻馴化過程中基因組的演化特點,并發(fā)現(xiàn)了多個纖維生長相關(guān)基因的馴化選擇印跡,相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《植物雜志(The Plant Journal)》上。
苧麻是我國特有的纖維作物,在我國已有數(shù)千年的種植歷史。近年來在我國南方地區(qū)苧麻被用作優(yōu)質(zhì)飼草。但苧麻纖維含量高,會顯著影響飼草加工效率和動物采食性能。因此,解析苧麻纖維形成機制,對于定向選育高纖維纖用苧麻或低纖維飼用苧麻均具有重要的意義。
分類學(xué)、遺傳學(xué)等研究表明栽培苧麻是從野生苧麻(Boehmeria nivea var. tenacissima)馴化而來,但野生苧麻纖維產(chǎn)量并不高??梢姡谠耘嗥r麻馴化過程中,纖維發(fā)育相關(guān)基因受到了重點選擇。然而,有關(guān)栽培苧麻的馴化分子機制,一直未被闡明。
研究人員測序組裝了野生種“青葉苧麻”和栽培種“中飼苧1號”基因組,得到兩個高質(zhì)量的基因組圖譜。通過序列比較發(fā)現(xiàn),兩個基因組存在大量序列變異。
研究人員進(jìn)一步對14個野生苧麻種質(zhì)和46個栽培種進(jìn)行重測序,并構(gòu)建了苧麻的基因組變異圖譜。通過野生和栽培種苧麻基因組組裝和比較,結(jié)合群體變異組分析,科研人員發(fā)現(xiàn)了多個與纖維產(chǎn)量相關(guān)的基因組片段具有清晰的馴化選擇印跡。
該研究得到國家自然科學(xué)基金,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工程和現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項目資助。
原文鏈接:https://doi.org/10.1111/tpj.15346
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